全县辖38个乡镇、4个街道办事处，有128个社区居委会、363个村民委员会。县政府驻蜀北街道，县城规划区幅员面积50平方公里，县城建城区面积31.3平方公里，常住人口39.2万。
1992年以前，有11个区，71个乡，11个镇。1992年，全县大面积调整区划建制，撤11个区，建25个镇。1995年又恢复31个镇、47个乡、13个区工委。1997年恢复到32个镇、48个乡、13个区工委（包括南隆镇、河东区、盘龙区、东坝区、王家区、楠木区、定水区、黄金区、建兴区、大桥区、伏虎区、升钟区、大坪区）。
2004年划归仪陇县管辖的有1乡、1镇(柴井乡、度门镇）后，南部县有31个镇，47个乡,13个区工委。
2006年夏秋之际，根据南部县委、县政府下发的南委发[2006]39号、南府发[2006]35号文件，撤销河东区、盘龙区、东坝区、王家区、楠木区、定水区、黄金区、建兴区、大桥区、伏虎区、升钟区、大坪区12个区工委；撤销高云乡、董家乡、凤台乡、水音乡、龙凤乡、义丰乡6个乡。全县辖31个镇，41个乡，6个办事处。
2010年4月，经四川省人民政府批准，将光华乡划归仪陇县；将原南部县南隆镇辖区范围原东城、南城、西城和北城办事处改设为滨江街道办事处、蜀北街道办事处，保留南隆镇建制，南隆镇现辖原金星、枣儿办事处范围，镇政府办公地设在金星场镇。2010年7月9日，调整方案正式实施。至此，南部县共有71个乡镇、2个街道办事处。
2019年11月，全省乡镇行政区划调整后，设置乡镇（街道）42个，其中乡5个、镇33个、街道4个。
截止2021年3月，南部县辖区乡镇、街道名单：
蜀北街道、滨江街道、满福街道、南隆街道
老鸦镇、楠木镇、永定镇、碑院镇、长坪镇、五灵乡
盘龙镇、谢河镇、石河镇、石龙镇、东坝镇、八尔湖镇
河坝镇、王家镇、铁佛塘镇、富利镇、定水镇、大王镇
黄金镇、建兴镇、三官镇、流马镇、大河镇、大桥镇
宏观乡、万年镇、伏虎镇、双佛镇、花罐镇、小元乡
升钟镇、西水镇、升水镇、大坪镇、双峰乡、太霞乡
桐坪镇、神坝镇
